Princip a význam metody arrayCGH v hemato-onkologii

Určení chromozómových změn u lidských nádorů vede k hlubšímu poznání příčin vzniku a vývoje nádorů. Častými chromozómovými změnami u nádorů jsou získané ztráty a zmnožení genetického materiálu s postižením chromozómových oblastí obsahujících řadu genů účastnících se buněčné proliferace a diferenciace, ale také onkogeny a nádorové supresory. Určení genových změn je limitováno citlivostí použitých technik. Se zavedením analýzy genomu pomocí čipových technologií (microarray technology) se významným způsobem posunula citlivost určování genetických změn i u nádorů. Metoda arrayCGH (array comparative genomic hybridization) dovoluje určit dávku genů v nádorovém genomu, přičemž v jednom vyšetření je možné analyzovat desítky až tisíce genů najednou. Její citlivost je limitována pouze hustotou genů umístěných na daném čipu. Cílem práce je informovat o principech metody array -CGH a možnostech jejího využití pro studium nebalancovaných změn nádorového genomu se zaměřením na hematologické malignity.

Klíčová slova:
DNA, in situ hybridizace, CGH, arrayCGH, čip, onkogen, nádorový supresor.

Principle and Importance of Using the Array CGH in Hematooncology

Identification of chromosomal changes and variation in DNA copy number allows us to understand pathogenesis of tumors. To the frequently diagnosed chromosomal changes belong acquired gains and losses of chromosomal regions carring genes involved in cellular proliferation and differentiation as well as oncogenes and tumor suppressor genes. The determination of gene changes is limited by techniques used for their identification. The introduction of genom-wide microarray technology, resolution has rapidly increased. Array comparative genomic hybridization (arrayCGH) offers higher resolution for genome-wide detection of chromosomal alteration and it is able to analyze hundreds to thousands of genes presented on microarray in one experiment. The aim of this study was to perform arrayCGH technology and to stress its value for the identification of chromosomal imbalances in hematological malignancies.

Key words:
DNA, in situ hybridization, CGH, arrayCGH, microarray, oncogene, tumor suppressor gene.

Autoři: M. Jarošová; H. Pospíšilová; R. Plachý; M. Divoká; M. Holzerová; T. Papajík; J. Koptíková ¹; K. Indrák
Působiště autorů: Hemato-onkologická klinika LF a FN, Olomouc ; Centrum biostatistiky a analýz LF a PřF MU, Brno ¹
Vyšlo v časopise: Čas. Lék. čes. 2006; 145: 9-13
Kategorie: Přehledový článek

Souhrn

Klíčová slova:
DNA, in situ hybridizace, CGH, arrayCGH, čip, onkogen, nádorový supresor.

Štítky

Adiktológia Alergológia a imunológia Angiológia Audiológia a foniatria Biochémia Dermatológia Detská gastroenterológia Detská chirurgia Detská kardiológia Detská neurológia Detská otorinolaryngológia Detská psychiatria Detská reumatológia Diabetológia Farmácia Chirurgia cievna Algeziológia Dentální hygienistka

Článek Některé nové poznatky o patogenezi myeloproliferativních onemocnění a možnosti jejich efektivnější léčby

Článek Acylaci stimulující protein – úloha v regulaci metabolizmu tukové tkáně

Článek Vysokodávkovaná terapie s autologní transplantací krvetvorných buněk u nemocných s Hodgkinovým lymfomem: dlouhodobé sledování nemocných léčených v jednom centru

Článek Význam kvantitativního hodnocení transkriptů BCR-ABL pomocí real-time PCR pro efektivní léčbu chronické myeloidní leukémie

Článek Význam konfirmačních testů HLA systému nepříbuzných dárců hematopoetických kmenových buněk

Článek Užití kvantitativního stanovení exprese genu Wilmsova tumoru 1 pro monitorování reziduální nemoci pacientů s akutní myeloidní leukémií

Článek Akutní nežádoucí účinky brachyterapie s vysokým dávkovým příkonem v kombinaci se zevní radioterapií u lokalizovaného karcinomu prostaty

Článek Familiární hemofagocytující lymfohistiocytóza na podkladě deficitu perforinu úspěšně léčená transplantací hematopoetických kmenových buněk – první diagnostikovaný případ v České republice

Článek Echinokoková nákaza – echinococcosis

Článek Zneužívání buprenorfinu se stává v České republice problémem

Článek Robotika v chirurgii

Článek Impakt faktor – dobrý sluha, ale špatný pán