XII. Precizní medicína a personalizovaný přístup v onkologii

77. PLATFORMA GENESIS: VÝSLEDKY INDIKACE TERAPIE NA ZÁKLADĚ GENOMICKÉHO PROFILOVÁNÍ U VÍCE NEŽ 2 600 PACIENTŮ A PŘECHOD K AKADEMICKÉ STUDII GENESIS PRO

GRELL P.¹, EID M.², KŘÍŽOVÁ L.³, KYSELA M.¹, MOHELNÍKOVÁ DUCHOŇOVÁ B.⁴, MELICHAR B.⁴, VOČKA M.³, LOHYNSKÁ R.⁵, SOUMAROVÁ R.⁶, LORDICK OBERMANNOVÁ R.¹

¹ Klinika komplexní onkologické péče, MOÚ Brno, ² Interní a hematologická klinika, FN Brno, ³ Onkologická klinika, VFN Praha, ⁴ Onkologická klinika, FN Olomouc, ⁵ Onkologická klinika, Fakultní Thomayerova nemocnice Praha, ⁶ Onkologická klinika, FNKV Praha

Národní platforma GENESIS představuje klíčový projekt české precizní onkologie, který sjednocuje komplexní onkologická centra a pracoviště dětské onkologie za účelem harmonizace a optimalizace rozhodovacích procesů molekulárních tumor boardů (MTB). Hlavním imperativem tohoto projektu je systematická integrace komplexního genomického profilování pomocí sekvenování nové generace (NGS) do personalizovaných léčebných algoritmů. V současné fázi platforma agreguje reálná klinická a genomická data robustního národního souboru zahrnujícího již > 2 600 konsekutivních pacientů se solidními malignitami. Tento unikátní soubor dat umožňuje detailní evaluaci terapeutických indikací, sledování frekvence záchytu akčních alterací a posouzení reálné implementace i klinického benefitu doporučení MTB v každodenní onkologické praxi. Devizou platformy GENESIS je její analytická flexibilita umožňující stratifikaci a prozkoumání specifických podskupin pacientů na základě komplexních biomarkerů. Příkladem je analýza efektu imunoterapie pomocí checkpoint inhibitorů u podskupiny pacientů se výšenou nádorovou mutační náloží (TMB), kde TMB funguje jako surogátní marker neoantigenní exprese korelující s terapeutickou odpovědí. Tyto analýzy dat z reálné klinické praxe (RWE) pomáhají zpřesňovat indikační kritéria. Dosavadní fungování platformy však zároveň obnažilo systémové limity precizní medicíny v ČR, zejména administrativní a finanční neudržitelnost individuálního schvalování úhrad inovativní péče přes mimořádné legislativní mechanizmy. Jako logické vyústění dosavadního vývoje a překonání těchto limitů se stává přirozeným a nezbytným dalším krokem zahájení akademické prospektivní multicentrické studie GENESIS PRO. Tento projekt, koncipovaný na principech mezinárodních struktur typu DRUP (Drug Rediscovery Protocol), umožní prospektivní hodnocení jasně definovaných kohort pacientů na základě přítomnosti specifických biomarkerů a jim alokované cílené terapie. Hlavním cílem je nejen získat validní akademická data, ale především etablovat udržitelný, transparentní a koncepční systémový model pro implementaci a úhradu personalizované protinádorové péče v ČR.

78. EARLIER ACCESS TO TARGETED AND PHASE I/II THERAPIES: HOW GERMANY’S REIMBURSED GENOME SEQUENCING MODEL PROJECT RESHAPES THE CANCER TREATMENT SEQUENCE

ROHLEDER E.

Charité Comprehensive Cancer Center Berlin

Since 2024, Germany has been piloting comprehensive molecular diagnostics (wholeexome/whole-genome sequencing) as a reimbursed statutory-health-insurance service through its nationwide model project on genome sequencing in rare and oncological diseases (Modellvorhaben Genomsequenzierung). For patients with advanced cancer who have exhausted established options, it provides a standardized, quality-assured route to deep molecular characterization that was previously largely confined to reference centres, clinical trials, or self-payers. Although national genomic initiatives exist elsewhere in Europe –⁠ the NHS Genomic Medicine. Service in the UK, PFMG2025 in France, or reimbursed WGS for cancer of unknown primary in the Netherlands –⁠ comprehensive sequencing within routine, reimbursed oncology care remains uncommon, and in most countries it is still largely confined to research and clinicaltrial settings. Real-world evidence on how reimbursement reshapes the treatment sequence is therefore still limited. Drawing on more than a year of hands-on experience, this talk shares practical insights and examines how nationwide availability of this elaborate and costly diagnostic affects the treatment sequence of patients with cancer, and whether they benefit from earlier access to individualized precision-oncology approaches, frequently delivered off-label or within phase I/II trials. Combining this context with first-hand experience from clinical practice, the presentation offers a candid assessment of where reimbursed comprehensive sequencing.

153. VLIV OBEZITY NA INCIDENCI A PROGNÓZU NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ

GESCHEIDTOVÁ L.

Oddělení laboratorní medicíny, MOÚ Brno

Obezita je v současnosti považována za významný a modifikovatelný rizikový faktor vzniku nádorových onemocnění. Podle odhadů je nadměrná tělesná hmotnost odpovědná až za 9 % malignit v rozvinutých zemích. Obezita prokazatelně zvyšuje riziko řady solidních nádorů, zejména karcinomu prsu u postmenopauzálních žen, kolorektálního karcinomu, karcinomu endometria, ledvin, jater, pankreatu či jícnu. Vztah mezi množstvím tělesného tuku a rizikem vzniku nádoru je lineární, s rostoucím množstvím tukové tkáně toto riziko stoupá. Jedinci s metabolicky nezdravou obezitou (tj. obezitou a vyjádřeným metabolickým syndromem) vykazují vyšší celkové riziko vzniku jakéhokoli nádorového onemocnění, zejména však tzv. s obezitou asociovaných malignit. Obezita zároveň negativně ovlivňuje průběh již diagnostikovaných nádorových onemocnění. Je spojena se zvýšeným rizikem relapsu a kratším obdobím bez známek onemocnění u řady solidních nádorů, včetně karcinomu prsu a kolorektálního karcinomu. Tento nepříznivý vliv je nezávislý na klinickém stadiu, typu léčby i dalších prognostických faktorech. U hormonálně dependentních nádorů je efekt obezity zvláště výrazný. Současně obezita zhoršuje celkovou prognózu pacientů a přispívá ke zvýšení mortality, mimo jiné i prostřednictvím vyššího kardiovaskulárního rizika, které je dále potencováno onkologickou léčbou s kardiotoxickým účinkem. Významnou roli v komplexní péči o onkologické pacienty proto hraje cílená redukce tělesné hmotnosti. Dlouhodobé snížení hmotnosti, zejména dosažené změnou životního stylu, je spojeno s redukcí rizika vzniku i recidivy některých nádorů. V léčbě obezity se uplatňují jak nefarmakologické postupy (úprava stravy, zvýšení fyzické aktivity, cílené změny životního stylu), tak moderní farmakoterapie, zejména agonisté GLP-1 receptoru a duální agonisté GLP-1/GIP. Klíčová je přitom multidisciplinární spolupráce zahrnující nutriční, pohybové i psychologické intervence s cílem dosažení dlouhodobě udržitelné redukce hmotnosti a zlepšení celkové prognózy pacientů. Obezita tak představuje nejen významný rizikový faktor vzniku nádorových onemocnění, ale i důležitý determinant jejich průběhu a léčebných výsledků. Efektivní management obezity by měl být integrální součástí onkologické péče.

164. DIGITÁLNÍ PCR JAKO NÁSTROJ PRO PRECIZNÍ KVANTIFIKACI NÁDOROVÝCH MARKERŮ V RÁMCI SLEDOVÁNÍ MRD/MDD U DĚTSKÝCH PACIENTŮ

KALFUSOVÁ A.¹, TRKOVÁ M.¹, ŠANDOVÁ M.¹, ŠIKLOVÁ A.¹, ŽÁKOVÁ P.¹, NĚMEČKOVÁ T.¹, SALAMONOVÁ I.¹, HAMAŇOVÁ D.¹, HÁČEK J.¹, ZÁMEČNÍK J.¹

¹ Ústav patologie a molekulární medicíny, 2. LF UK a FNMH Praha

Východiska: Sledování minimální reziduální (MRD) a diseminované (MDD) nemoci představuje významný nástroj pro volbu léčebného postupu a hodnocení léčebné odpovědi, časnou detekci relapsu a stratifikaci rizika u dětských onkologických pacientů. V posledních letech se do popředí dostávají vysoce senzitivní molekulární metody umožňující detekci nádorově specifických alterací v periferní krvi nebo kostní dřeni. Digitální PCR (dPCR) umožňuje vysoce citlivou a kvantitativní detekci nádorových markerů a představuje perspektivní metodu pro monitoraci MRD/MDD u hematologických i solidních malignit dětského věku. Materiál a metody: V rámci detekce MRD/MDD byli vyšetřeni pediatričtí pacienti s anaplastickým velkobuněčným lymfomem (ALCL, 17 pacientů, 107 vzorků), alveolárním nebo embryonálním rabdomyosarkomem (a/e RMS, 11 pacientů, 54 vzorků) a histiocytózou z Langerhansových buněk (LCH, 7 pacientů, 33 vzorků). U jednotlivých diagnóz byly pomocí digitální PCR sledovány nádorově specifické markery ve vzorcích primárních nádorů, následně v buňkách periferní krve a v kostní dřeni, případně cirkulující nádorová DNA ve vzorcích plazmy. U ALCL byla monitorována přítomnost fúzního transkriptu NPM1:: ALK, u RMS markery rhabdomyoblastické diferenciace, konkrétně MYOD1, myogenin, ACHR, případně fúzní geny PAX3:: FOXO1, event. PAX7:: FOXO1 a přítomnost mutace p.V600E v genu BRAF u LCH. Detekce přítomnosti, resp. exprese jednotlivých markerů byla realizována na platformě dPCR s cílem zhodnotit využitelnost dané technologie pro detekci MRD/MDD v klinické praxi. Výsledky: Metoda dPCR umožnila vysoce senzitivní detekci sledovaných alterací v buňkách periferní krve a kostních dřeních i cfDNA ve vzorcích plazmy. U části pacientů byla přítomnost cirkulující nádorové DNA nebo nádorově specifických transkriptů detekována i v období minimální nebo kompletní klinické remise. Průběžné monitorování molekulární odpovědi korelovalo s klinickým průběhem onemocnění a u vybraných pacientů umožnilo zachytit molekulární relaps před manifestací klinické progrese. Výsledky současně potvrzují potenciál dPCR pro kvantitativní sledování dynamiky onemocnění během terapie. Závěr: Digitální PCR představuje citlivou, rychlou a reprodukovatelnou metodu vhodnou pro monitoraci MRD/MDD u vybraných dětských malignit. Zavedení dPCR do rutinní diagnostické praxe může přispět k přesnější stratifikaci pacientů, individualizaci léčby a časné identifikaci relapsu onemocnění.

Podpořeno Ministerstvem zdravotnictví ČR –⁠ institucionální podporou FN Motol, 00064203.

180. OD GENETICKÉHO TESTOVÁNÍ PO CÍLENOU LÉČBU: MOLEKULÁRNÍ TUMOR BOARD, INOVATIVNÍ STUDIE, PROJEKT GENESIS, AKADEMICKÁ STUDIE GENESIS-PRO

GRELL P., LORDICK OBERMANNOVÁ R.

Klinika komplexní onkologické péče, MOÚ Brno

Implementace precizní onkologie do rutinní klinické praxe představuje jeden z klíčových pilířů moderní onkologické péče. Úspěšná transformace komplexních genomických dat získaných metodou masivního paralelního sekvenování (NGS) do personalizovaných terapeutických strategií však vyžaduje robustní multidisciplinární zázemí a inovativní metodické přístupy. Klíčové postavení v tomto procesu má Molekulární tumor board (MTB), který slouží jako expertní platforma pro klinickou interpretaci nalezených alterací a jejich klasifikaci z hlediska terapeutické akčnosti. V tuzemském kontextu byl pro efektivní analýzu výsledků a rozhodovacích procesů MTB vytvořen národní projekt GENESIS. Tato platforma systematicky sbírá výsledky doporučení MTB z komplexních onkologických center v celé ČR a agreguje validní data o klinické efektivitě následně podané cílené terapie. Dosavadní reálná praxe ukázala, že jednou z hlavních bariér plnohodnotného rozvoje precizní medicíny a uplatnění genomických nálezů v klinické praxi zůstává reálná dostupnost doporučených inovativních léčiv mimo schválené indikace. Na tento kritický deficit bezprostředně reaguje nově koncipovaná akademická studie GENESIS-PRO. Jedná se o prospektivní, multicentrické klinické hodnocení typu DRUP-like (Drug Rediscovery Protocol), které je navrženo s flexibilním designem kohort podle specifických molekulárních alterací. Cílem této inovativní iniciativy je překlenout mezeru mezi diagnostickým nálezem a terapeutickou nedostupností tím, že indikovaným pacientům s raritními či specifickými mutacemi (včetně komplexních ko-mutací) umožní řízený a bezpečný přístup k cílené off-label terapii. Studie zároveň implementuje rigidní metodiku sběru klinických dat se zaměřením na klíčové parametry efektivity léčby a toxicity, čímž generuje robustní RWE data (Real-World Evidence). Propojení retrospektivně-analytické platformy GENESIS a prospektivního ramene GENESIS-PRO v rámci MTB tak vytváří ucelený národní ekosystém, který zásadním způsobem optimalizuje cestu onkologického pacienta k personalizované léčbě.

266. BRAFI+MEKI TERAPIE POKROČILÉHO CHOLANGIOKARCINOMU: PŘÍPAD VÝBORNÉ ODPOVĚDI NA CÍLENOU LÉČBU INDIKOVANOU NA ZÁKLADĚ PRŮKAZU BRAF MUTACE POMOCÍ NGS ANALÝZY U VELMI PŘEDLÉČENÉ PACIENTKY S POKROČILÝM CHCC

ŠULC D., PUKYOVÁ J.

Onkologická klinika, Masarykova nemocnice, Krajská zdravotní, a. s. Ústí nad Labem

Východiska: Cholangiokarcinom (ChCC) je onemocnění závažné svojí vysokou mortalitou. Ve většině případů je indikována systémová terapie, kde má doposud hlavní úlohu chemoterapie, jejíž účinnost je však omezená. Z nových možností systémové terapie je nejčastěji indikována imunoterapie v kombinaci s chemoterapií. Ještě větší pozornost se pak upíná na indikace léčby, která je predikována na základě detekce výskytu targetovatelných mutací NGS analýzou. ChCC vykazuje vysokou častost (40–50 %) výskytu genomických alterací, které mohou být léčebným cílem. Nejčastěji lze nalézt mutace a přestavby IDH1/2 a FGFR2, dále se pak častěji vyskytuje i overexprese HER2. Oproti tomu výskyt mutace BRAF V600E je vzácný (1–5 %), a tak zkušenosti s léčbou BRAFmt ChCC jsou ojedinělé. Jeden takový zajímavý případ zde nyní prezentujeme. Popis případu: Pacientka, rok nar. 1967, byla diagnostikována v 11/2023, kdy u ní byl na UZ a CT zjištěn multifokální ložiskový proces jater, histologicky ChCC. Možnost operability byla vyloučena a byla indikována prvoliniová CHT v režimu cisplatina + gemcitabin. Po pěti cyklech léčby bylo dosaženo PR tumoru v levém laloku a bylo indikováno operační řešení –⁠ hemihepatektomie sin + excize z PL jater (7/2024, FNKV). Multifokální ChCC byl prokázán v 7cm ložisku v levém laloku, dále ve dvou ložiscích PL jater a ve třech uzlinách. Již na CT v říjnu 2024 byla zjištěna progrese ložisek v pravém laloku jater a vzestup Ca19-9. Ve druhé linii léčby byla indikována chemoterapie FOLFOX (6×, 11/24–3/25, PD). Do 3. linie byl pak indikován irinotecan Q3W (7×, 5–8/2025, s výraznou toxicitou) a zároveň již bylo zajištěno NGS testování. Na MR jater 7/2025 byla zjištěna významná progrese v pravém laloku jater. U této pacientky, která i přes podání tří linií systémové léčby byla ve velmi dobrém stavu (ECOG PS 0), byla pomocí NGS prokázána přítomnost mutace BRAF V600E. Případ byl zhodnocen v rámci MTB a byla doporučena léčba trametinibem s dabrafenibem a po schválení úhrady léčby revizním lékařem byla léčba 19. 9. 2025 zahájena. Léčba doposud pokračuje v plné dávce, tj. dabrafenib 300 mg denně + trametinib 2 mg denně. Efekt byl pozorovatelný velmi časně dle TM. Dle CT 12/25 a 3/26 a bylo dosaženo výrazné parciální remise. Aktuálně je pacientka léčena cílenou terapií 8 měsíců, s výbornou tolerancí. Závěr: ChCC je diagnóza, kde má NGS velmi důležitou pozici a potenciál výrazně zlepšit prognózu pacientů s tímto závažným onemocněním. Uvedený případ tuto skutečnost potvrzuje a ukazuje, že má smysl pátrat po výskytu i velmi vzácných mutací, které mohou být dobrým léčebným cílem.

301. PREVENCE TOXICIT IMUNOTERAPIE A PREDIKCE ODPOVĚDI PACIENTŮ S TRIPLE-NEGATIVNÍM KARCINOMEM PRSU POMOCÍ IMUNITNÍHO PROFILOVÁNÍ A MALDI MS FINGERPRINTINGU

KUNDRATOVÁ M.¹, PEČINKA L.¹, VAVRUŠÁKOVÁ B.¹, SELINGEROVÁ I.², KOLOUŠKOVÁ I.³, HOLÁNEK M.³, MORÁŇ L.¹, KAZDA T.⁴

¹ Výzkumné centrum aplikované molekulární onkologie, MOÚ Brno, ² Oddělení klinických studií, MOÚ Brno, ³ Klinika komplexní onkologické péče, MOÚ Brno, ⁴ Klinika radiační onkologie, MOÚ Brno

Triple-negativní karcinom prsu (TNBC) je vysoce agresivní podtyp s omezenými možnostmi léčby. Přidání pembrolizumabu k neoadjuvantní chemoterapii zlepšuje přežití pacientek. S ohledem na maximalizaci benefitu a prevenci toxicity však přináší výzvu v podobě přesnější identifikace profitujících pacientek a včasné predikce imunitně podmíněných nežádoucích účinků (irAEs). Předpokládáme, že imunitně metabolické interakce nádorového mikroprostředí se odrážejí ve specifických profilech v séru, které by mohly sloužit jako neinvazivní biomarkery patologické kompletní odpovědi (pCR) i rizika irAEs. Studovaná kohorta zahrnuje pacientky s TNBC léčené neoadjuvantní chemoimunoterapií (n = 26), na základě odpovědi stratifikované na skupinu s pCR a bez pCR (non-pCR), a zdravé dárkyně (HD; n = 15). Mikroprostředí nádorů bylo imunofluorescenčně analyzováno na imunitní markery (CD3, CD4, CD8, FOXP3), markery vyčerpání (TIGIT, LAG-3, LAYN), stres endoplazmatického retikula (BiP, CHOP) a markery imunitních kontrolních bodů (PD-1). Systémový dopad léčby byl hodnocen v séru pomocí MALDI hmotnostní spektrometrie (MS). Zpracování dat zahrnovalo PCA a algoritmy strojového učení (ML): náhodný les (RF), rozhodovací strom (DT), k-nejbližšího souseda (k-NN), umělé neuronové sítě (ANN) a metodu částečných nejmenších čtverců (PLS-DA). MALDI MS profilování séra spolehlivě odlišilo pacientky s TNBC od HD i od HER2-pozitivního karcinomu prsu. ML modely s vysokou přesností stratifikovaly pCR a non-pCR pacientky již ze vzorků před zahájením terapie, přičemž oddělení skupin zůstalo zachováno i na odběrech v průběhu léčby (po 6 a více měsících). Jako potenciální diskriminační peak byl identifikován zkrácený apolipoprotein C-I ( m/z 6436 Da) vykazující vyšší intenzitu u pCR skupiny. Predikce výskytu irAEs se ukázala jako nedostatečná (přesnost 66 %). Sérové profily korelují se znaky prostorové fenotypizace tkání, kde byla příznivá odpověď spojena s vyšší infiltrací CD4+ T-lymfocytů a lokalizovaným stresem endoplazmatického retikula (CHOP). MALDI MS v kombinaci s ML představuje slibný neinvazivní nástroj pro hodnocení odpovědi na imunoterapii. Objasnění spojení mezi lokálním nádorovým mikroprostředím a systémovými metabolickými profily otevírá cestu k personalizovanému přístupu a přesnější stratifikaci pacientek s TNBC.

331. IMUNOTERAPIE U KARCINOMU PROSTATY, ŠANCE NA DLOUHÝ A KVALITNÍ ŽIVOT PŘI VČASNÉM NGS TESTOVÁNÍ

SOVIŠOVÁ M.

Onkologické oddělení, Krajská nemocnice T. Bati Zlín

Karcinom prostaty je nejčastějším nádorem u mužů, avšak varianta MSI-high je velmi raritní (2–3 %). Následující kazuistika popisuje pacienta s vysokou mutační náloží a MSI nestabilitou a jak důležitou roli hraje NGS testování u pacienta s minimální či nulovou odpovědí na standartní terapii. Terapie v kazuistice vychází z klinických studií Inspire, Neptune. Pacient s anamnézou nádorové duplicity, sarkom LU pravé axily po extirpaci, diagnóza i terapie mimo naše pracoviště (radioterapie v protonovém centru), t. č. trvá remise. Duplicitně generalizovaný lokálně pokročilý karcinom prostaty, GS 9, G5, prorůstání do rekta, po derivační sigmoideostomii pro ileus. Terapie LHRH + ARTA, hemostyptické radioterapii pro enteroragii, s efektem lokoregionální regrese, negativizace PSA. Pro rychlou progresi PSA, cholin PET/CT progrese meta hepar, 1L paliativní chemoterapie docetaxel 3W s přímou progresí. Proveden NGS panel a v rámci vyloučení relapsu tumoru axily druhé čtení histologie, překvapivě původní nález překlasifikován na mal. melanom. Provedena konfirmační biopsie ložiska jater, potvrzena meta karcinom prostaty. Pro rychlý vzestup PSA do 2L pal. CHT kabazitaxel, v mezičase obdržen výsledek NGS panel, dle výsledku se jedná o tumor mikrosatelitně nestabilní, s vysokou mutační náloží patogenní varianta (MSH2 –⁠ TMB 45, BRCA2) –⁠ pacient je tedy vhodný adept k imunoterapii checkpoint inhibitory, dále možný benefit z terapie PARP, TMB předpokládá větší benefit z imunoterapie, jako druhá volba PARP inhibitory, doplněno genetické vyšetření –⁠ negativní. Pro výborný výkonnostní stav, po schválení žádosti na p16 zahájena kombinovaná imunoterapie nivolumab + ipilimumab, již po první sérii dochází k významnému poklesu PSA (z 27 na 1,33), po druhé sérii negativizace PSA na ultralow, trvale v hodnotě < 0,01, cholin PET/CT –⁠ významný PR, minimální akumulace. Od páté série samotný nivolumab 3 mg/kg, léčba dle protokolu studie pokračováno rok, nyní režim sledování, ke dni 13. 5. 2026 trvá negativní PSA 0,01, PS 0-1. t.č. v plánu 7/2026. Z této kazuistiky jednoznačně vyplývá, že přestože se jedná o raritní typ karcinomu prostaty stran biologického chování, je nutné v případě rychlé progrese v průběhu konvenční terapii myslet na včasné NGS testování. Cílená terapie může pro pacienta znamenat významné zlepšení doby přežití a kvality života.

367. SÉROVÉ HLADINY LNCRNA SH3GL3-5 : 3 JSOU SPOJENY S PROGNÓZOU METASTATICKÉHO KARCINOMU PROSTATY LÉČENÉHO ARTA PŘÍPRAVKY

WINDRICHOVÁ J.¹, FIALA O.², GRUNDMANNOVÁ H.¹, POLÍVKA J.³, PEŠTA M.⁴, TOPOLČAN O.¹, FÍNEK J.²

¹ Oddělení imunochemické diagnostiky, FN Plzeň, ² Onkologická a radioterapeutická klinika, FN Plzeň, ³ Biomedicínské centrum, LF UK Plzeň, ⁴ Ústav biologie, LF UK Plzeň

In the present retrospective study we focused on the prognostic role of serum long non-coding RNA (lncRNAs) in metastatic castration-resistant prostate cancer patients treated with the next-generation androgen receptor signaling inhibitors (ARSIs) represented by abiraterone acetate or enzalutamide. Patients with histologically confirmed mCRPC were treated between 2007 and 2023 at the Department of Oncology and Radiotherapeutics, University Hospital in Pilsen by ABI in combination with prednisone or ENZ. The therapy was continued until disease progression, unacceptable toxicity, or patient refusal. The routine clinical checks including physical examination and biochemical laboratory tests were performed each month. RNA was extracted from 200 μL sera using Isolation RNA kit on a MagNA Pure Compact (Roche Diagnostics). Using TaqMan Human Prostate Cancer Array Card (Thermo Fisher Scientific) was tested more than 70 circulating lncRNAs as biomarker candidates. Genes of ACTB and GAPDH, which were part of the TaqMan Array Card, were used as exogenous controls. Expression of lncRNA Hs05299364_s1 corresponding to Lnc-SH3GL3-5 was analysed as statistically significant. It was identified as the sole independent risk factor significantly associated with shorter PFS and OS, i.e., disease progression and death. An antisense lncRNA localized within the HDGFRP3 locus, may represent a novel regulator of transcriptional and epigenetic programs associated with prostate cancer progression and response to androgen receptor–targeted therapy (ARTA). Integrative analyses suggested that Lnc-SH3GL3-5 is functionally linked to HDGFRP3-mediated chromatin and transcriptional networks involving CDK12, CDK13, BRPF1, and BAZ2B, participating in RNA polymerase II transcription and adaptive transcriptional plasticity. Given the role of CDK12/13 in AR pathway, dysregulation of the Lnc-SH3GL3-5/HDGFRP3 axis may contribute to resistance-associated transcriptional reprogramming. These findings position Lnc-SH3GL3-5 as a potential biomarker and mechanistic modulator of (ARSIs) response in prostate cancer.

This study was supported by Ministry of Health, Czech Republic –⁠ conceptual development of research organization (Faculty Hospital in Pilsen –⁠ FNPl, 00669806). Samples collection and storage was supported by the project BBMRI.cz, reg. no. LM2023033.