Multilokusová sekvenační typizace streptokokůskupiny A izolovaných z invazivních onemocněnív České republice v roce 2003
Multilokusová sekvenační typizace streptokokůskupiny A izolovaných z invazivních onemocněnív České republice v roce 2003
V článku jsou prezentovány první výsledky charakterizace 29 invazivních kmenů Streptococcuspyogenes, izolovaných v České republice v první polovině roku 2003, metodou multilokusové sekvenačnítypizace (MLST). U žádného z 16 přítomných emm typů nebyla mezi kmeny našeho souboruzjištěna variabilita sekvenčních typů (ST). První výsledky MLST ukazují, že populace kmenůzpůsobujících závažná onemocnění v České republice je odlišná od kmenů izolovaných v zahraničí.U sedmi kmenů byly popsány nové sekvenční typy: ST134, ST308, ST336, 5T340, obsahující novékombinace známých alel a ST341 se třemi dosud nepopsanými alelami (gki 91, murI 65 a yqiL 60),zjištěný u třech kmenů. Nově popsané sekvenční typy byly registrovány v celosvětové databáziMLST S. pyogenes.
Klíčová slova:
invazivní GAS – klonální analýza – MLST – streptokok.
Multilocus Sequence Typing of Group A Streptococci Isolatedfrom Invasive Diseases in the Czech Republic in 2003
First results of multilocus sequence typing (MLST) for characterization of 29 invasive Streptococcuspyogenes strains isolated in the Czech Republic in the first half of 2003 are presented. None of 16emm types detected among the study strains showed sequence type (ST) variability. The MLSTresults are indicative of differences between the strains causing serious diseases in the CzechRepublic and those isolated in other countries. In seven strains, four new STs with known alleles innew combinations, ST134, ST308, ST336, ST340, and one new ST with three as yet undescribed alleles(gki 91, murI 65 and yqiL 60), ST341, were described. These newly described STs were submitted tothe web-based reference MLST database for S. pyogenes.
Key words:
invasive group A streptococci – clonal analysis – MLST – streptococcus.
Autoři:
L. Straková; P. Křížová
Působiště autorů:
Centrum epidemiologie a mikrobiologie, Státní zdravotní ústav, Praha
Vyšlo v časopise:
Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. , 2004, č. 4, s. 190-193
Kategorie:
Články
Souhrn
V článku jsou prezentovány první výsledky charakterizace 29 invazivních kmenů Streptococcuspyogenes, izolovaných v České republice v první polovině roku 2003, metodou multilokusové sekvenačnítypizace (MLST). U žádného z 16 přítomných emm typů nebyla mezi kmeny našeho souboruzjištěna variabilita sekvenčních typů (ST). První výsledky MLST ukazují, že populace kmenůzpůsobujících závažná onemocnění v České republice je odlišná od kmenů izolovaných v zahraničí.U sedmi kmenů byly popsány nové sekvenční typy: ST134, ST308, ST336, 5T340, obsahující novékombinace známých alel a ST341 se třemi dosud nepopsanými alelami (gki 91, murI 65 a yqiL 60),zjištěný u třech kmenů. Nově popsané sekvenční typy byly registrovány v celosvětové databáziMLST S. pyogenes.
Klíčová slova:
invazivní GAS – klonální analýza – MLST – streptokok.
Štítky
Hygiena a epidemiológia Infekčné lekárstvo MikrobiológiaČlánok vyšiel v časopise
Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie
2004 Číslo 4
- Parazitičtí červi v terapii Crohnovy choroby a dalších zánětlivých autoimunitních onemocnění
- Vliv komorbidit na účinnost ceftarolin-fosamilu u komplikovaných infekcí kůže a měkkých tkání − sdružená analýza 3 studií
- Očkování proti virové hemoragické horečce Ebola experimentální vakcínou rVSVDG-ZEBOV-GP
- Koronavirus hýbe světem: Víte jak se chránit a jak postupovat v případě podezření?
Najčítanejšie v tomto čísle
- Multilokusová sekvenační typizace streptokokůskupiny A izolovaných z invazivních onemocněnív České republice v roce 2003
- Rezistence k makrolidům u druhu Streptococcuspyogenes v České republice v období let 1996–2003
- Systém externích kontrol kvality v lékařskémikrobiologii a parazitologii v České republice
- Vliv změn klimatu na výskyt klíšťové encefalitidyv České republice v uplynulých dvaceti letech