VIII. Precizní medicína a personalizovaný přístup v onkologii

VIII/106. Integrative precision oncology –⁠ building sustainable structures for the future

Westphalen B.

University of Munich, Germany

Background: The transformative potential of precision oncology, offering targeted treatments tailored to individual patients‘ genetic profiles, is increasingly recognized. However, several hurdles impede its widespread implementation. Critical challenges include inconsistent access to quality-assured diagnostics, a healthcare workforce often unfamiliar with genomic medicine, and disparities in access to targeted therapies. This presentation aims to shed light on these key issues, providing actionable insights for scalable solutions. Objective: The objective of this presentation is to provide a potential way for scaling and implementing precision oncology effectively. Focused attention will be given to three core areas: 1) quality-assured diagnostics: A deep dive into the challenges and solutions in standardizing diagnostic tests across different platforms and geographic regions; 2) genomics-savvy workforce: exploration of innovative educational approaches, including specialized training modules, to prepare healthcare professionals for the genomic era of medicine; 3) equitable access to targeted therapies. A discussion on healthcare policy reforms and multi-sector collaborations needed for minimizing disparities in access to individualized cancer care. Conclusions: To harness the full potential of precision oncology, we must address the interlinked challenges of quality diagnostics, workforce readiness, and equitable access to treatments.

VIII/108. Tumor mutation burden (un) reliable biomarker

Křížová Ľ.

Onkologická klinika 1. LF UK a VFN v Praze

Tumor mutation burden (TMB) is a controversial predictive biomarker of checkpoint inhibitors (ICI) efficacy. Due to the fact that TMB assessment methods are not standardized, the threshold differs across platforms and clinical trials, oncologists are in a difficult position deciding the indication of checkpoint inhibitors based on TMB level. Although the Food and Drug Administration (FDA) approved pembrolizumab for all solid tumors tumor with TMB-high (> 10 mut/Mb), this approval was never applied in Europe. Recent publications have demonstrated different reporting value of TMB in different tumor types. In some oncological diagnosis, TMB is more useful then in others and also it is assumed that one TMB cut-off is not applicable to all cancers. Thus, current clinical practice referring to Keynote 158 when clinicians indicate ICI in patients with TMB > 10 mut/Mb regardless the oncological diagnosis needs to be re-evaluated. Although we lack the prospective trials, we have to apply the available data and knowledge to our everyday decision making and consider the indication of ICI based on TMB individually case by case, following the true principles of precision oncology.

VIII/215. Kombinovaná léčba refrakterních a relabovaných nádorů dětského věku s využitím vakcíny z dendritických buněk

Polášková K.1, Kýr M.1, Múdry P.1, Valík D.2, Zdražilová Dubská L.2, Černá Pilátová K.3, Štěrba J.1

1 Klinika dětské onkologie LF MU a FN Brno, 2 Ústav laboratorní medicíny LF MU a FN Brno, 3 Farmakologický ústav, MU Brno

Východiska: U dětí s nádorovým onemocněním je známo pouze malé množství „driving“ mutací, které by byly terapeuticky ovlivnitelné. Dětské nádory patří mezi velmi vzácné diagnózy, a proto i přes velký rozvoj v onkologické léčbě u dospělých pacientů nejsou dostatečná data pro jejich užití v dětské onkologii. Avšak ukazuje se, že imunitní systém dětí je, podobně jako u dospělých, vhodným terapeutickým cílem. Smyslem tohoto sdělení je prezentovat účinnost multimodální terapie a personalizované vakcíny z dendritických buněk. Metody: Byl analyzován soubor dětských pacientů, kteří byli léčeni na Klinice dětské onkologie v období 2016–2022 za využití dendritické vakcíny. Tito pacienti byli také léčeni kombinací nízce dávkované metronomické chemoterapie, cílené léčby a imunoterapie. Hodnocené parametry byly analyzovány za pomoci Coxova modelu proporcionálních rizik. Vzhledem k heterogenitě souboru byl na jeho hodnocení aplikován analytický přístup N-of-1 studií. Výsledky: Celkem bylo do analýzy zařazeno 48 pacientů, u nichž bylo hodnoceno 160 událostí, z toho 22 úmrtí a 138 progresí/relapsů. Medián follow-up byl 4 roky. Celkové přežití kohorty bylo 7,03 roku. Analýza přežití ukázala trend směrem k nižšímu riziku události v období podávání dendritické vakcíny a výrazněji byl tento efekt patrný ve skupině pacientů, kteří překonali 2 roky od diagnózy (HR = 0,53; p = 0,048). Nejsilnější efekt byl nalezen při podávání immune checkpoint inhibitorů po primingu vakcínou z dendritických buněk. Závěr: Multimodální individualizovaná léčba prodlužuje přežití u vysoce rizikových solidních tumorů u dětí ve srovnání s historickými daty. Slibným přístupem, který by zasloužil další výzkum, je u vybraných pacientů navození imunitní reakce za pomoci dendritické vakcíny a následná udržovací léčba s imunomodulačním efektem.

VIII/341. Predictive biomarkers testing –⁠ from simple tests to complex genomic profiling era

Kubová B., Kunčíková K., Šimová J., Urbanovská I., Konvalinka D., Měch R., Satková P., Žmolíková J., Pitronová S., Uvírová M.

1 EUC Laboratoře CGB a. s. Ostrava, Czech Republic

Background: Molecular profiling of tumors is increasingly important as more therapies are indicated in biomarker-defined patient populations. Next-generation sequencing (NGS) is the diagnostic method of choice to assess relevant biomarkers simultaneously from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumor tissues or liquid biopsies, avoiding the need to perform sequential individual tests. Purpose: Since 2009, when we started analyses of selected somatic mutations (KRAS and EGFR genes) by various molecular biology methods (real time PCR, primer extension method, reverse hybridization etc.) in colorectal and NSCLC cancer patients, many new biomarkers were well established in routine diagnostics in different tumors types. Generally, all molecular biology methods have several advantages (such as sensitivity, specificity, cost-effectiveness, ultrafast turnaround time etc.) and have also many limitations (such as limited multiplexing capability, amount of DNA input etc.). Currently, we are using NGS technology routinely in our laboratory (UltraDeep amplicon sequencing, fastGEN technology, BioVendor) because it allows covering several different alterations simultaneously, even from low DNA input, and provides information on the fraction of alleles carrying the mutations. For comprehensive genomic profiling of tumor sample we used TruSight Oncology 500 kit (Illumina). Conclusion: From the laboratory diagnostics perspective, it is crucial to adopt a tailored methodology to cover all the clinically relevant gene alterations in the different clinical settings. Currently, complex genomic profiling (changes on DNA and RNA levels) has become increasingly important for therapeutic decision making and is growingly used for treatment selection in patients with advanced cancer. Interdisciplinary cooperation (molecular tumor board) has become essential in managing the treatment of patients with the approval of new targeted therapies.