Roche a IBM spolupracují na vývoji technologie sekvenování DNA

PRAHA: Společnosti Roche a IBM se staly partnery pro vývoj technologie založené na nanopórech, která bude rychle a efektivně číst (sekvenovat) lidskou DNA. Spolupráce, která je zaměřena na další vývoj nedávno uvedené technologie IBM „DNA tranzistoru“, bude těžit z vedoucí pozice IBM v oblasti mikroelektroniky, informačních technologií a výpočetní biologie a z vedoucí pozice společnosti Roche v oblasti lékařského výzkumu, molekulární biologie a sekvenování genomu.

Nová technologie vyvinutá divizí IBM Research umožňuje sekvenování jednotlivých molekul DNA procházejících nanometrickým pórem v křemíkovém čipu. Tento přístup slibuje výrazné výhody z hlediska nákladů, šíře aplikačního použití a rychlosti oproti technologiím sekvenování, které jsou v současné době k dispozici nebo ve vývoji.

„Spojením schopností na poli výpočetní biologie, biotechnologie a nanotechnologie se blížíme k vytvoření systému, který dokáže rychle a přesně převádět informace uložené v DNA na lékařsky relevantní genetické informace,“ uvedl Ajay Royyuru, senior manažer oddělení výpočetní biologie v divizi IBM Research. „Výzvou u všech technologií sekvenování založeného na nanopórech je zpomalení a kontrola pohybu sekvenované DNA nanopórem. Proto vyvíjíme takovou technologii, která tuto kontrolu pohybu DNA nanopórem umožní tak, aby čtecí zařízení mohlo přesně dekódovat sekvenci DNA.“

Tato technologie má díky vysoké sekvenační kapacitě a snížení nákladů potenciál naplnit vizi osekvenování celého lidského genomu jednotlivce za cenu od sta do jednoho tisíce dolarů. Snadný přístup ke genomu jednotlivce by mohl umožnit personalizaci lékařské péče v šíři, o které v tomto okamžiku můžeme pouze snít.

„Sekvenování je čím dál tím důležitějším nástrojem pro personalizovanou medicínu. Může poskytnout individuální genetické informace nezbytné pro efektivní diagnostiku a cílenou léčbu chorob,“ podotkl Manfred Baier, ředitel Roche Applied Science, jež je součástí skupiny Roche. „Jsme přesvědčení, že tato účinná technologie v kombinaci s vysokou odborností IBM a Roche přinese levné a přesné sekvenování celého genomu se všemi jeho přínosy na trh rychleji, než se dříve považovalo za možné.“

V rámci dohody bude Roche financovat další vývoj technologie v laboratořích IBM a prostřednictvím spolupráce se svou dceřinou společností 454 Life Sciences, která se na sekvenování specializuje v rámci skupiny Roche, poskytne také další zdroje a odborné znalosti. Roche bude následně vyvíjet a prodávat všechny produkty založené na této technologii.

Investice společnosti Roche do genomických technologií budoucnosti staví na síle současných sekvenačních systémů 454, které generují stovky tisíc dlouhých, vysoce kvalitních sekvenačních čtení v řádu hodin.

Pro genomickou analýzu ve velkém měřítku je tato technologie k dispozici na přístroji GS FLX System (dva takové systémy pracují i v České republice) a pro střední laboratoře je k dispozici GS Junior System uvedený na trh v EU v květnu tohoto roku. Sekvenační systémy 454 prokázaly a prokazují významnou lékařskou hodnotu v aplikacích cíleného resekvenování pro virologický a onkologický výzkum a jako takové budou první technologií právě nastupující generace sekvenování, která se dostane z laboratoří do praktického použití ve  zdravotnictví.

O společnosti Roche

Společnost Roche sídlí v Basileji a řadí se do čela světových farmaceutických firem zaměřených na výzkum. V oboru biotechnologií je dokonce na první příčce. Produkty společnosti Roche tvoří velmi úzce diferencovaná léčiva určená k léčbě zhoubných onemocnění, dále antivirotika, protizánětlivé léky, léky určené pro choroby metabolismu a centrálního nervového systému.

Společnost Roche je také světovým leaderem v oblasti in vitro diagnostiky a histologické diagnostiky zhoubných onemocnění.

V roce 2009 zaměstnávala společnost Roche ve světě více než 80 000 zaměstnanců a do výzkumu a vývoje investovala přibližně 10 milliard švýcarských franků. Obrat společnosti dosáhl 49,1 milliard švýcarských franků. Společnost Genentech (USA) je plně vlastněným členem Roche Group. Roche patří též majoritní kapitálový podíl ve společnosti Chugai Pharmaceutical (Japonsko).